Zależność między przewidywaniami opartymi na ekspresji genów w przypadku raka piersi cd

Wartości P uzyskano z testu log-rank. X oznacza obserwacje, które zostały ocenzurowane ze względu na utratę obserwacji lub w dniu ostatniego kontaktu. Tabela 1. Tabela 1. Klasyfikacja zestawu danych pacjenta z holenderskiego Instytutu Raka według pięciu modeli opartych na ekspresji genów. W przypadku wszystkich 295 nowotworów wszystkie modele oparte na ekspresji genów, z wyjątkiem modelu stosunku dwóch genów, stanu receptora estrogenu, stopnia złośliwości guza, średnicy guza i stanu węzła były istotnymi predyktorami przeżycia wolnego od nawrotów i całkowitego przeżycia, zgodnie z jednowymiarowym Analiza przeżycia Kaplana-Meiera (ryc. i tabela 1). W przypadku czterech znaczących modeli, grupy o złym wyniku były zgodne z oczekiwaniami: osoby o słabym profilu 70-genu, aktywowanej odpowiedzi na rany, wysokim wskaźniku nawrotu i podstawnokształtnym, opalizującym B oraz HER2 + i ER- wewnętrznym podtypy.
Aby ocenić wartość prognostyczną każdego modelu opartego na ekspresji genu, przeprowadziliśmy następnie analizę ryzyka proporcjonalnego Coxa na wielu odmianach – obejmującą stan estrogenu, stopień guza, stan węzła, wiek, średnicę guza i status leczenia – każdego modelu indywidualnie (tabela 2 w dodatkowym dodatku). Modele oparte na swoistym podtypie, profilu 70-genu, odpowiedzi na rany i wskaźniku nawrotu były znaczącymi predyktorami zarówno przeżycia wolnego od nawrotów, jak i całkowitego przeżycia. Zatem każdy profil ekspresji genu (z wyjątkiem stosunku dwóch genów) dodawał nowe i ważne informacje prognostyczne wykraczające poza to, które zapewniały standardowe predyktory kliniczne. W rzeczywistości profile 70-genowe, punkt końcowy nawrotu i profil podtypowy były najbardziej przewidywalnymi zmiennymi w każdej analizie, co odzwierciedla ich najniższa nominalna wartość P.
Tabela 2. Tabela 2. Klasyfikacja próbek nowotworów od wszystkich 295 pacjentów, w zależności od zastosowanego modelu. Jako punkt odniesienia, następnie analizowaliśmy każdy model w odniesieniu do przypisań podtypów wewnętrznych, które w dużej mierze opierały się na nienadzorowanej analizie profili ekspresji genów nowotworu sutka (Tabela 2). Wszystkie 53 nowotwory podobne do podstawnych zostały sklasyfikowane jako mające wysoki wskaźnik nawrotów i słabe profile 70-genowe, a 50 zostało sklasyfikowanych jako posiadające podpis aktywowanej reakcji na rany. Prawie identyczne odkrycie zaobserwowano dla podtypu HER2 + i ER, a także dla słabo wynikowego podtypu B światła, zdefiniowanego klinicznie jako ER +. Odwrotnie, nowotwory typu normalnego i luminalnego A wykazywały heterogeniczność pod względem tego, w jaki sposób zostały sklasyfikowane przez inne modele; jednak 62 z 70 próbek z niskimi wynikami nawrotów było podtypu światła lędźwiowego. Dane te sugerują, że jeśli próbka zostanie sklasyfikowana jako podstawna, HER2 + i ER- lub luminalna B, to najprawdopodobniej będzie ona w złych prognozowanych grupach modeli 70-genowych, odpowiedzi na ranę i modeli punktacji .
Następnie porównaliśmy wyniki modeli 70-genowych, odpowiedzi na ranę, powtarzalności i dwóch genów ze sobą, wykorzystując dwukierunkowe analizy tablic kontyngencji. W przypadku tych analiz połączyliśmy kategorie niskiego i średniego powtarzania punktów w jedną grupę, ponieważ ich krzywe przeżycia nie różniły się istotnie (tabela 2E w Dodatku uzupełniającym). Wszystkie porównania dały znaczące korelacje, przy czym model z dwoma genami miał najniższy poziom korelacji
[podobne: przychodnia chełm rejestracja internetowa, vitadent, viva michałowice ]
[patrz też: inerbiotyk c, viva michałowice, adam dawidziuk twitter ]