Zależność między przewidywaniami opartymi na ekspresji genów w przypadku raka piersi ad

Zastosowano profile oparte na ekspresji genu, model 70-genowy dobry w stosunku do złego opracowany przez van de Vijver i in. i van t Veer i wsp., 2,3 model odpowiedzi na rany opracowany przez Chang i wsp., 4,5 model rekurencyjno-punktowy opracowany przez Paika i wsp., 6 model samoistny podtypu (światło A, światło lumina- B, bazowy, HER2-dodatni i negatywny pod względem receptora estrogenowego [HER2 + i ER-] i prawidłowy piersiopodobny) opracowany przez Perou i współpracowników, 1,9,12,13 i model z dwoma genami ( stosunek poziomów ekspresji homeoboxu 13 [HOXB13] i receptora interleukiny 17B [IL17BR]) .7 (Prognozy dla każdego modelu przedstawiono w Dodatkowym dodatku.) Modele punktacji nawrotu i dwa-genowe były pierwotnie zaprojektowane w celu przewidywania wyników u pacjentów z chorobą ER +, którzy otrzymywali tamoksyfen. 6. Przeprowadziliśmy zatem oddzielne analizy dla podgrupy próbek ER + i dla całego zestawu próbek ER + i ER- łącznie. Szczegółowy opis sposobu zastosowania tych metod do zestawu danych próby 295 znajduje się w dodatkowym dodatku. Przetrwanie
Aby ocenić wartość prognostyczną każdego modelu opartego na ekspresji genu, wykonaliśmy jednoczynnikową analizę Kaplana-Meiera przy użyciu testu logarytmicznego rang Coxa-Mantela w programie WinStat for Excel (oprogramowanie R. Fitch). Wykorzystaliśmy również oprogramowanie SAS do przeprowadzenia wieloczynnikowej analizy proporcjonalnych zagrożeń Coxa każdego modelu indywidualnie w modelu, który zawierał status estrogenu-receptor (pozytywny vs. negatywny), stopień złośliwości guza (1 vs. 2 i vs. 3), status węzła (brak węzłów dodatnich w porównaniu z jednym do trzech dodatnich węzłów i brak węzłów pozytywnych w porównaniu z więcej niż trzema dodatnimi węzłami), wiek (jako zmienna ciągła), średnica guza (2 cm lub mniej w porównaniu z ponad 2 cm) oraz leczenie otrzymane (brak terapii adjuwantowej w porównaniu z chemioterapią, terapią hormonalną lub obiema). Bezwstrząsowy czas przeżycia (definiowany jako czas do pierwszego zdarzenia) i całkowity czas przeżycia były punktami końcowymi. (W przypadku wieloczynnikowej analizy swoistych podtypów i wyniku nawrotu, status receptora estrogenu nie został uwzględniony jako zmienna, ponieważ był oparty na tych samych danych z mikromacierzy, które były używane w modelach ekspresji genów).
Dwukierunkowe analizy tablic kontyngencji i obliczenia statystyki V Cramer za pomocą WinStat for Excel. Statystyka V Cramera dostarcza ilościową miarę siły powiązania między dwiema zmiennymi w tabeli kontyngencji (informacje, których nie można uzyskać z wartości P). Wartości mieszczą się w zakresie od 0 do 1, przy czym 0 oznacza brak związku, a oznacza doskonałe powiązanie. Tradycyjnie wartości od 0,36 do 0,49 wskazują na istotną zależność, a wartości 0,50 lub więcej wskazują na silny związek. Statystka V jest uogólnieniem bardziej znanej statystyki phi dla tablic kontyngencji bez dwóch po dwóch, a dla tabel dwie na dwie statystyka V jest równa statystykom phi.
Wyniki
Analiza wszystkich nowotworów
Rycina 1. Rycina 1. Szacowanie przeżywalności Kaplan-Meier z przeżycia wolnego od nawrotów i całkowitego przeżycia wśród 295 pacjentów, według podtypu wewnętrznego (panele A i B), wskaźnika nawrotu (panele C i D), profilu 70-genu ( Panele E i F), Odpowiedź na ranę (panele G i H) i stosunek dwóch genów (panele I i J)
[przypisy: vitadent, lekarz ginekolog endokrynolog, nfz małopolska kolejka do sanatorium ]
[hasła pokrewne: mallak gniezno, nexteer gliwice, fama milicz ]