Zależność między przewidywaniami opartymi na ekspresji genów w przypadku raka piersi ad 6

W szczególności z 105 próbek o niskim lub średnim odsetku nawrotów 83 zostały sklasyfikowane jako mające dobry profil 70-genu. Nie wykonywaliśmy wieloczynnikowych analiz proporcjonalnych hazardów Coxa przy użyciu wszystkich predyktorów jednocześnie, aby zidentyfikować optymalny model dla grupy 225-osobowej lub 295-osobowej. Sądziliśmy, że nie byłoby to uczciwym testem dla żadnego modelu, dla którego grupa ta byłaby prawdziwym zestawem testowym (wskaźnik nawrotów i stosunek dwóch genów) lub dla tych, które zostały opracowane przy użyciu innej platformy (wynik powtórzeń, dwa -regionalny stosunek i wewnętrzny podtyp).
Dyskusja
Przeanalizowaliśmy pojedynczy zestaw danych, dla którego zbadano wystarczającą liczbę genów, aby umożliwić równoczesną analizę pięciu modeli opartych na ekspresji genów. Cztery z tych modeli dały podobne przewidywania – na przykład każdy model przypisywał te same próbki do grup o słabych wynikach. Nowotwory sklasyfikowane jako podstawowe, HER2 + i ER- oraz luminal B według modelu swoistego podtypu były prawie wszystkie klasyfikowane jako mające słaby wynik (niezależnie od statusu estrogenu) przez gen 70, wynik nawrotu i rany – modele odpowiedzi. Jedynie w obrębie podświetlenia A i normalnych podtypów własnych była zmienność w przewidywanych wynikach.
Spośród pięciu modeli analizowanych w naszym badaniu, tylko wskaźnik dwóch genów nie zidentyfikował istotnych różnic w wyniku w zbiorze danych. W niezależnym zbiorze danych pacjentów z chorobą ER +, którzy otrzymywali tamoksyfen, Reid i in. donoszą, że model dwunogowy nie wykrył różnic w wyniku16. Jednak Goetz et al. wykazali, że u kobiet z ujemną chorobą węzła z grupy Northern Cancer Treatment Group, badanie 89-30-52, stosunek dwóch genów był istotnym czynnikiem prognostycznym przeżycia bez nawrotów choroby i przeżycia bez choroby17. Model oparty na analizie tylko dwa geny są znacznie bardziej wrażliwe na różnice techniczne w platformach analitycznych niż te oparte na wielu genach i możliwe jest, że jedna z cech reprezentujących HOXB13 lub IL17BR w zestawie danych Niderlandzkiego Instytutu Raka może nie odzwierciedlać wiernie wartości patrz Ma i wsp., 7 z powodu alternatywnego splicingu lub różnic w warunkach hybrydyzacji sondy.
Porównania parami modeli 70-genowych, odpowiedzi na rany, oceny nawrotów i modeli dwumowych wykazały, że wyniki wszystkich modeli poza dwoma genami były bardzo zgodne. Porównanie modeli 70-genowych i rekurencyjnych-score wykazało, że ich prognozy dotyczące próbek zgadzały się z 77% pacjentów z rakiem ER + i 81% wszystkich pacjentów. Analizy te sugerują, że pomimo niewielkiego nakładania się genów (profile 70-genowe i rekurencyjność-score pokrywają się tylko z jednym genem: SCUBE2) i zastosowano różne algorytmy, prognozy wyników dla większości pacjentów z rakiem piersi byłyby podobne . Jest również prawdopodobne, że model punktacji nawrotowej, pierwotnie opracowany dla pacjentów z chorobą ER +, jest trafny dla wszystkich pacjentów z rakiem piersi, ponieważ prawie wszyscy (69 z 70) pacjentów z guzami ER byli klasyfikowani jako posiadający wysoki odsetek nawrotów.
Prognozy wyników wyprowadzone z różnych modeli w dużej mierze pokrywały się, zgodnie z wielowymiarowymi analizami proporcjonalnego hazardu Coxa (przedziały ufności 95% współczynników ryzyka dla wolnego od nawrotów i całkowitego czasu przeżycia podano w Tabeli 2 w dodatkowym dodatku)
[przypisy: bomar kielce, korona porcelanowa cennik, vitadent ]
[patrz też: centrum witek łomianki, czyścioch białystok, bomar kielce ]